青少年科技社团是青少年校园科学课堂的有益补充和拓展，是青少年校外科技活动的重要场所。近年来，青少年科技活动普及率逐步提高，青少年素质教育，青少年科技创新活动越来越得到了高邮实小师生以及家长们的重视和支持。
在扬州市科协和扬州市教育局联合举办的第二届青少年科技模型竞赛活动中，该校学生积极参加此项活动，成绩突出，其中周业润和迮星宇荣获飞机模型项目(小学组)一等奖、徐歌、陈鸿谙和冯安邦获荣获二等奖，唐可欣等五人荣获三等奖;周林老师也被评为扬州市优秀科技辅导员。
自2013年高邮实验小学成为“扬州市少年科学院高邮实小分院”以来，在学校领导的关心支持下，学校蓬勃开展了各类科技活动，如航模、科技小发明、小制作、金钥匙竞赛、电子百拼等，不仅在教师、学生中获得良好的反响，使学校形成了浓厚的科学氛围，而且在省市级的各项比赛中取得优秀的成绩，培养了一批具有创新意识、科学素养的优秀学生。
